《事业单位会计准则（试行）》和《事业单位会计制度》从１９９８年１月１日起开始执行，并将据此颁布实施特殊行业事业单位会计制度。这标志着我国社会主义市场经济体制下的事业单位会计法规体系的初步建立和启动。此次事业单位会计改革涉及的范围之广、触及的层次之深、变化的内容之多，是建国以来最大的一次会计模式性变革。在新旧事业单位会计模式转换之际，为使广大事业单位财会工作者尽快理清改革基本思路，掌握改革基本内容，为正确的核算操作提供指导，笔者试从七个方面对事业单位会计改革加以介绍。
一、与行政单位会计分离，形成独立的事业单位会计体系改革前，事业单位和行政单位统一执行财政部１９８８年颁发的《事业行政单位预算会计制度》。随着社会主义市场经济体制的建立和发展，事业单位和行政单位的区别越来越明显。从它们在国民经济中的作用看，事业单位主要用精神产品和各种劳务形式，以实现社会效益为宗旨，向社会提供生产性或生活性服务。行政单位主要是行使国家行政职能，从事国家管理。由于二者在国民经济中的作用不同，造成它们在社会主义市场经济中的地位和收入对市场的依赖性不同。事业单位是市场经济的参与者，要参与市场竞争，行政单位是市场经济的组织指挥者，不能参与市场竞争；事业单位可以根据自身的特点、优势，从市场中取得发展事业所需的收入，行政单位则不能依靠权力从市场中谋取收入，只能依靠财政拨款来满足支出需要。由于事业单位收入的相当大部分甚至全部来自市场，也引起会计核算的许多方面与行政单位不同。所以，就不能像过去计划经济那样，以经费来源都是财政拨款为标志，将它们划归一种类型，统一执行一个《事业行政单位预算会计制度》，应该分别执行《事业单位会计制度》和《行政单位会计制度》。
二、采用“准则”加“制度”，并用“准则”和“通用制度”规范、指导特殊行业制度的法规模式会计准则在我国会计法规体系中居于承上启下的中间环节。会计制度对会计工作的规定比较明确具体，可直接据以进行会计操作，而准则比较概括、抽象和原则，具体操作还必须依照准则要求制定的会计制度。我国现行的会计准则分为企业会计准则和事业单位会计准则。我国的财政总预算会计和行政单位会计，由于计划性、统一性很强，由财政部直接制定会计制度即可，勿须制定会计准则。而事业单位涉及的行业多，在社会主义市场经济条件下，其经济业务的规模、方式、对市场的依赖程度和核算的要求等方面都差别较大，需要依据“准则”制定通用事业单位会计制度和特殊行业事业单位会计制。新的《事业单位会计制度》，就是通用的事业单位会计制度。它依据《事业单位会计准则（试行）》制定，供非特殊行业事业单位执行，并对制定特殊行业事业单位会计制度起示范性作用。特殊行业事业单位会计制度主要有：科研单位会计制度、医院会计制度、高等学校会计制度、艺术表演团体会计制度等。事业单位会计采用“准则”加“制度”，“通用制度”示范“特殊行业制度”的模式，是这次事业单位会计改革的一项创新，它适应事业单位行业多、差别大的实际情况。
三、会计记帐方法改资金收付记帐法为借贷记帐法事业单位出于自身发展的需要，各事业单位之间、事业单位与其他经济单位之间相互投资，创办经济实体。这些投资参股业务要求会计核算增强主体观念，国有资产得以保值和增值，并且要求事业性收支与经营性收支相对分开，对经营性业务要采用权责发生制和配比原则，以便分别考核盈亏。上述这些是资金收付记帐法难以作到的。而借贷记帐法是国际上通用的、与市场经济原则相融合的一种记帐方法，能够利用其帐户分类、记帐规则和试算平衡去满足市场经济条件下经济业务的各种要求，并克服了资金收付记帐法帐户分类、记帐规则和试算平衡不适应市场经济要求的缺陷。
四、取消全额、差额和自收自支三套会计科目，制定一套事业单位通用会计科目新的《事业单位会计制度》，设置一套通用会计科目，取消原全额、差额和自收自支三套会计科目，是因为１９９７年１月１日执行的《事业单位财务规则》，将原事业单位实行的全额、差额和自收自支三种预算管理形式，改为一种预算管理形式：即对所有事业单位实行“核定收支、定额或者定项补助、超支不补、结余留用”一种预算管理形式。作为通用事业单位会计制度的重要组成部分——会计科目，必然要反映财务管理制度的这一要求，用一套会计科目来核算一般事业单位的经济业务。
五、改预算内资金和预算外资金分别核算为统一核算改革前，全额预算管理单位的会计核算，分为“预算资金部分”和“其他资金部分”，分设两套帐务组织，各自平衡。预算外资金的核算是“其他资金部分”内容之一。预算外资金分设“预算外收入”、“预算外支出”等科目核算其收支和结余情况。新《事业单位会计制度》将收入分为：“财政补助收入”、“上级补助收入 ”、“拨入专款”、“事业收入”、“经营收入”、“附属单位缴款”和“其他收入”。事业单位收到的“预算外资金”作为“事业收入”的组成部分入帐，支出按照性质划分，不再单独设帐反映。事业单位取得预算外资金的所有权归财政，事业单位留用预算外资金是财政对其注入资金的一种渠道，注入多少，注入的方式如何，要由财政部门来决定。根据各事业单位的具体情况，财政部门对其实行“全额上缴”、“结余上缴”和“按比例上缴”三种管理办法。凡留归事业单位的预算外资金，作增加“事业收入”处理，财政从预算内注入的资金，作增加“财政补助收入”处理。年终都汇转至“事业结余”科目的贷方。另外，预算外资金的定义与原来也不同。原预算外资金是指根据国家财政、财务制度规定，不纳入国家预算，由各地方、各部门、各企事业单位自收自支，自行管理的财政性资金。包括事业单位管理的各项不纳入预算的资金。国发（１９９６）２９号文件对预算外资金重新作了规定：预算外资金是指国家机关、事业单位和社会团体为履行或代行政府职能，依据国家法律、法规和具有法律效力的规章而收取、提取和安排使用的未纳入国家预算管理的各种财政性资金。具体项目由各省级财政部门规定。有一点需强调，预算外资金是事业单位履行或代行政府职能收取的，所有权归政府，管理权归财政，收缴权归事业单位。
六、将三要素改为五要素原制度将会计对象分为资金来源、资金运用和资金结存三大会计要素。这次事业单位会计改革借鉴了企业会计改革的成功经验和国际惯例，并结合事业单位的实际，将会计对象划分为资产、负债、净资产、收入和支出五大会计要素。资产是指事业单位占有或者使用的能以货币计量的经济资源。它包括流动资产和非流动资产。流动资产分为货币资产、债权资产和实物资产。非流动资产包括对外投资、固定资产和无形资产；负债是指事业单位所承担的能以货币计量，需要以资产或劳务偿付的债务。包括经营性负债和非经营性负债两部分；净资产是指事业单位资产减去负债的差额。与企业所有者权益相比，事业单位的净资产不体现权益，不参与利润分配，表明不以盈利为目的。它包括限定用途净资产、非限定用途净资产和当年实现净资产三部分；收入是指事业单位为开展业务活动，依法取得的非偿还性资金。它包括财政补助收入、调拨性收入、专业性收入、经营性收入、限定用途收入和其他收入；支出是指事业单位为开展业务活动和其他活动所发生的各项资金耗费及损失。包括监控性支出、专门性支出、主体性支出、兼营性支出和调拨性支出。五个会计要素之间的关系是：资产＋支出＝负债＋净资产＋收入；收入＿支出＝当年实现的净资产。
七、实行新的会计报表体系这次事业单位会计改革，对不同类型事业单位的财务报表作了统一规范。过去不同行业事业单位的报表体系各不相同，反映的内容差别较大，既不通用，也无可比性，财政部门和主管部门很难从宏观上汇总出口径一致的、完整的财务指标。为了增强报表的通用性和可比性，改革后的事业单位会计报表包括资产负债表、收入支出表、附表及会计报表附注、收支情况说明书等；对有专款收支业务的单位，应根据财政部门或主管部门的要求编报专款资金收支情况表；事业单位还可根据财务管理需要，自行设置一些辅助报表
